При заполнении аквариума гидробионтами важно, чтобы все его обитатели равномерно распределялись по слоям воды, и при этом не мешали друг другу.

Различные виды рыб предпочитают разные слои воды — верхние, средние, нижние.

Рыбы, которые держатся вблизи поверхности: брызгуны, петушки, и другие, не нуждаются в высоком аквариуме: в этом случае нижние слои будут пустовать. Данным видам рыб лучше увеличить площадь поверхности воды. Стоит также учитывать, что многие виды рыб, держащиеся в верхних слоях воды,  любят «попрыгать» над поверхностью воды, поэтому им необходимо сделать расстояние от поверхности до покровного стекла не менее 10-15 см.

В аквариум с такими рыбами рекомендуется поместить плавающие по поверхности растения, но при этом важно не закрыть бОльшую часть поверхности например риччией, так как при этом рыбы лишатся возможности для плавания.

По возможности, рекомендуется также натянуть полиэтиленовую пенку на поверхности биотопа, чтобы «прыгающие» рыбы меньше травмировались от ударов об стекло.

Рыбы, живущие на дне биотопа: боции, сомы, бычки и другие,  предъявляют другие требования к обустройству подводного мира. Они любят направленный ток воды вблизи дна. Как правило, сомы не вредят растениям, и  с большинством видов донных сомов и сомов-присосок можно содержать абсолютно любые виды растений.

Рыбы, держащиеся преимущественно в средних слоях воды: живородящие, харациновые и многие другие, требуют как свободного для плавания пространства, так и густозасаженных уголков, либо пещер и гротов, где они могли бы спрятаться от хищников или выбрать место для нереста. Средний слой — самый плотнозаселенный в биотопе.

Таким рыбам подойдет аквариум с высоким и широким видовым стеклом.

Как определить, в каком слое воды предпочитает держаться та или иная рыбка?

Существует метод определения по ее рту: если пасть рыбки развернута кверху, то данная порода предпочитает верхний слой воды, под поверхностью; при направленности рта вдоль средней линии тела — рыбка среднего слоя; если пасть смотрит вниз — придонная порода. Однако этот метод правилен не во всех случаях.

О предпочтительных слоях обитания рыбы говорит и форма ее тела.

Рыб, готовых смертельно отстаивать свои территориальные пространства, не так уж и много. Большинство видов готово менять привычки в условиях аквариумной скученности, и здесь уже задача аквариумиста создать обитателям всех уровней приемлемые условия для жизни. Например, барбусы, в целом, «колонизируют» все слои воды, однако при появлении на дне хищного сома, они тут же переселяются в верхние слои биотопа. Здесь и должен вмешаться аквариумист: например, создать дополнительные терраски, добавить длинностебельные или плавающие растения, а также возможно изменить схему освещения.

При выборе аквариумных рыб надо учитывать разные моменты их поведения и требования к содержанию. Немаловажным является правильный выбор и рациональное заполнение слоев воды рыбами в биотопе, совместимость рыб. Игнорирование данного аспекта приведет к перенаселенности биотопа, запугивании одних рыб другими,  дракам между гидробионтами, и в конечном итоге — их гибели.